Στις 3 Σεπτεμβρίου 2023 ο Φρανσίσκο Ορτέγκα μπήκε για πρώτη φορά στο γήπεδο σε επίσημο αγώνα με τον Ολυμπιακό.
Ήταν στην εντός έδρας νίκη επί της Λαμίας (4-0) για τη Super League. Την Κυριακή (8/2) συμπλήρωσε την 100ή παρουσία του με τα Ερυθρόλευκα, με τις 62 από αυτές να είναι για το πρωτάθλημα της Super League, όπου έχει σημειώσει και ένα τέρμα — στις 13 Σεπτεμβρίου 2025, στην αναμέτρηση Ολυμπιακός – Πανσερραϊκός 5-0.
Στις ευρωπαϊκές διοργανώσεις μετρά 30 αγώνες, ενώ έχει επτά συμμετοχές στο Κύπελλο Ελλάδος και μία στο Super Cup.
